- a -

• addChild() : suffixTree.c
• addNodes() : decoder.c
• addSymbol() : fsmTree.h , fsmTree.c
• allocStatistics() : statistics.h , statistics.c
• allocstreetab() : wotd.c

- b -

• bit_ftell_input() : bitio.c , bitio.h
• bit_ftell_output() : bitio.h , bitio.c
• buildAlpha() : alpha.c , alpha.h
• buildSTree() : wotd.h , wotd.c
• buildSuffixTree() : suffixTree.c , suffixTree.h
• buildTree() : wotd.c

- c -

• canonize() : decoderTree.c , fsmTree.c , suffixTree.c
• compareTrees() : fsmTree.c , fsmTree.h
• compareTreesRec() : fsmTree.c
• copyStatistics() : fsmTree.h , fsmTree.c
• copyStatisticsRec() : fsmTree.c

- d -

• decode() : decoder.c , decoder.h
• decodeBin() : decoder.h

- e -

• encode() : encoder.c , encoder.h
• encode_symbol() : coder.h , coder.c
• encodeBin() : encoder.h
• escapeCost() : gammaFunc.c , gammaFunc.h
• evalLogGamma() : gammaFunc.c
• evalLogGamma2() : gammaFunc.c
• evalrootsuccedges() : wotd.c
• evalsuccedges() : wotd.c
• evaluateeager() : wotd.c
• evaluatenodeeager() : wotd.c

- f -

• fastCanonize() : decoderTree.c , fsmTree.c
• file2String() : mapfile.h , mapfile.c
• fileOpen() : mapfile.c
• fileParts() : mapfile.c
• fixParents() : encoder.c , decoder.c
• flush_arithmetic_encoder() : coder.c , coder.h
• flush_output_bitstream() : bitio.c , bitio.h
• freeBuffer() : statistics.c , statistics.h
• freeDecoderTree() : decoderTree.h , decoderTree.c
• freeFsmTree() : fsmTree.c , fsmTree.h
• freeStatistics() : statistics.c , statistics.h
• freeSuffixTree() : suffixTree.c , suffixTree.h
• freetextspace() : mapfile.c , mapfile.h
• fsmSuffixTree() : suffixTree.h , suffixTree.c

- g -

• genfile2String() : mapfile.c
• get3ByteRepresentation() : see.c
• get_current_count() : coder.h , coder.c
• getHeight() : fsmTree.c , fsmTree.h
• getInternalNodeCount() : fsmTree.c
• getnextbranch() : wotd.c
• getnextsibling() : wotd.c
• getsbufferspaceeager() : wotd.c
• getSeeStateDecoder() : see.c , see.h
• getSeeStateEncoder() : see.h , see.c
• getStatistics() : statistics.h , statistics.c
• grouplcp() : wotd.c

- h -

• hAlpha() : gammaFunc.c , gammaFunc.h

- i -

• initDecoderTree() : decoderTree.c , decoderTree.h
• initDecoderTreeStack() : decoderTree.h , decoderTree.c
• initFsmTree() : fsmTree.c , fsmTree.h
• initialize_arithmetic_decoder() : coder.h , coder.c
• initialize_arithmetic_encoder() : coder.c , coder.h
• initialize_input_bitstream() : bitio.c , bitio.h
• initialize_output_bitstream() : bitio.c , bitio.h
• initSee() : see.h , see.c
• initSuffixTree() : suffixTree.c , suffixTree.h
• inittree() : wotd.c
• input_bit() : bitio.c , bitio.h
• insert() : decoderTree.c , fsmTree.c
• isRootDecoderTree() : decoderTree.h , decoderTree.c
• isRootFsmTree() : fsmTree.h , fsmTree.c

- k -

• kt() : gammaFunc.c , gammaFunc.h

- l -

• log2Alpha() : gammaFunc.c , gammaFunc.h

- m -

• main() : main.c
• makeDecoderFsm() : decoderTree.c , decoderTree.h
• makeFsm() : fsmTree.c , fsmTree.h

- n -

• nodeCost() : gammaFunc.c , gammaFunc.h

- o -

• output_bit() : bitio.c , bitio.h

- p -

• printContext() : fsmTree.c , fsmTree.h
• printUsage() : main.c
• propagateTransitions() : decoderTree.c , fsmTree.c
• prune() : wotd.c
• prune2() : wotd.c
• pruneRoot() : wotd.c
• pruneSubTree() : suffixTree.c
• pruneSuffixTree() : suffixTree.c , suffixTree.h

- r -

• readAlphabet() : main.c
• readByte() : main.c
• readDecoderTree() : decoderTree.h , decoderTree.c
• readDecoderTreeRec() : decoderTree.c
• readEncoder() : decoderTree.c
• remove_symbol_from_stream() : coder.h , coder.c
• rescale() : decoder.c , encoder.c
• returnStatistics() : statistics.c , statistics.h
• reverseinplace() : reverse.c , reverse.h
• reversestring() : reverse.h , reverse.c
• reverseString2Binary() : reverse.h , reverse.c

- s -

• setMaxCount() : reset.c , reset.h
• sortByChar() : wotd.c
• sortByChar0() : wotd.c

- t -

• testAndSplit() : suffixTree.c

- u -

• unzip() : main.c
• update() : suffixTree.c
• updateSee() : see.c , see.h

- v -

• verify() : decoderTree.c , fsmTree.c
• verifyDecoder() : decoderTree.c , decoderTree.h

- w -

• wotd() : wotd.c
• writeAlphabet() : main.c
• writeByte() : main.c
• writeEncoder() : fsmTree.c
• writeFsmTree() : fsmTree.c , fsmTree.h
• writeFsmTreeRec() : fsmTree.c

- z -

• zip() : main.c