[Predictomica] Fwd:

Tue Mar 1 14:12:27 UYT 2016

El concepto se puede aplicar a estimacion de matrices de covariancias "big" pero ralas? Por ejemplo, en genomica construimos matrices de covariancia entre miles de variables pero con muestras chicas. Ejemplo: datos de expresion con 50 mil variables pero n=20-100.

Creo que algo asi seria novedoso.

Daniel

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From: Ignacio Ramirez Paulino <ignacio.ramirez at gmail.com>
Sent: Tuesday, March 1, 2016 10:30 AM
To: CROSSA HIRIART, José Luis Francisco (CIMMYT); Ignacio Ramirez Paulino; DANIEL GIANOLA
Cc: predictomica at fing.edu.uy
Subject: Re: [Predictomica] Fwd:

Bueno, no sé, como decía Daniel, todo depende de la pregunta que quieras hacerte.
En realidad aplicar MDL a cada problema es un arte, por lo que lo que tendría que tener yo sería un conjunto de datos como para usar de ejemplo en la charla. Ojalá me de el tiempo para aplicarlo de manera más o menos razonable a ese conjunto de datos; eso sería de por sí un paper probablemente, muy similar al que mandó Daniel.

Pero si vamos a hacer algo en marzo, más bien podríamos empezar con un conjunto de datos y un objetivo concreto, y por lo menos trabajar de manera más o menos abstracta con esos datos para llevar el hilo de la charla, no sé si me explico.

On 01/03/16 11:52, CROSSA HIRIART, José Luis Francisco (CIMMYT) wrote:

Hola Daniel y Nacho

Por datos en plant breeding no hay problema. Como? que estructura?, que variables? Cuantos markers?

Abrazo

Jose

From: predictomica-bounces at fing.edu.uy<mailto:predictomica-bounces at fing.edu.uy> [mailto:predictomica-bounces at fing.edu.uy] On Behalf Of Ignacio Ramirez Paulino
Sent: Tuesday, March 01, 2016 6:50 AM
To: DANIEL GIANOLA
Cc: predictomica at fing.edu.uy<mailto:predictomica at fing.edu.uy>
Subject: Re: [Predictomica] Fwd:

Excelente! Hagámoslo entonces. Estaría buenísimo conseguir algún ejemplo relevante, algún dataset que les parezca particularmente interesante, y aplicarle una metodología tipo MDL para ilustrar sus conceptos. Qué les parece?

De su lado preciso un dataset y una propuesta de fecha dentro del grupo.

Saludos,

Nacho.

El 1 de marzo de 2016, 09:44, DANIEL GIANOLA<gianola at ansci.wisc.edu<mailto:gianola at ansci.wisc.edu>> escribió:

Ignacio,

Gracias por los comentarios.

Personalmente, tengo curiosidad sobre el tema, y una charla me resultaria interesante, especialmente si fuera ilustrada sobre alguna aplicacion concreta.

Creo que es a traves de este tipo de dialogos que se pueden "estirar" los campos de la ciencia, asi como crear  nuevos ambitos de aplicacion.

Daniel

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From: Ignacio Ramirez Paulino <<mailto:nacho at fing.edu.uy>nacho at fing.edu.uy<mailto:nacho at fing.edu.uy>>
Sent: Tuesday, March 1, 2016 6:28 AM
To: DANIEL GIANOLA
Cc: Maine Fariello; <mailto:predictomica at fing.edu.uy> predictomica at fing.edu.uy<mailto:predictomica at fing.edu.uy>
Subject: Re: [Predictomica] Fwd:

Hola Daniel,

Bueno, no exactamente. Suficiencia estadística es algo muy puntual. MDL bastante más general que eso.
Es todo un marco matemático (a mi entender el más profundo y moderno  de todos los que hay en la vuelta) para entender el problema de modelado estadístico de datos.

La descripcion de Wikipedia está incluso bastante mal. Hay quienes insisten en que no es más que un sinónimo para BIC (en Wikipedia dice básicamente eso, sin decirlo, al final), pero eso es incorrecto. Eso sólo tiene sentido en un regimen asintótico estricto.

Si les interesa les puedo dar una charla sobre MDL. Yo realmente creo que no se le da la importancia que debería tener, en parte porque BIC y AIC son muy fáciles de usar, y MDL es bastante díficil desde un punto de vista de implementación, pero vale la pena.

El 29 de febrero de 2016, 23:40, DANIEL GIANOLA<gianola at ansci.wisc.edu<mailto:gianola at ansci.wisc.edu>> escribió:

Mire MDL en Wikipedia. Me dio la impresion que hay un cierto paralelo con el concepto de suficiencia en estadistica. Me equivoco?

Daniel

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From: predictomica-bounces at fing.edu.uy<mailto:predictomica-bounces at fing.edu.uy> <predictomica-bounces at fing.edu.uy<mailto:predictomica-bounces at fing.edu.uy>> on behalf of Ignacio Ramirez Paulino <nacho at fing.edu.uy<mailto:nacho at fing.edu.uy>>
Sent: Monday, February 29, 2016 5:38 PM
To: Maine Fariello
Cc: <mailto:predictomica at fing.edu.uy> predictomica at fing.edu.uy<mailto:predictomica at fing.edu.uy>
Subject: Re: [Predictomica] Fwd:

Es interesante. Una pena que el autor no mencione  MDL (Minimum Description Length), que justamente abordan el tema de modelado de datos desde un punto de vista que en cierto sentido concilia, y de manera muy sólida, la dicotomía que se plantea en el paper...

El 29 de febrero de 2016, 15:25, Maine Fariello<<mailto:fariello at fing.edu.uy>fariello at fing.edu.uy<mailto:fariello at fing.edu.uy>> escribió:

A pedido de Daniel, les re-envío paper que puede ser de interés, sobre si explicar o predecir.

Saludos,

Maine.

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