A continuación se detallan las principales líneas de investigación:

- Etanol combustible
- Butanol (vía fermentación ABE / IBE)
- Enzimas microbianas (proteasas, lipasas)
- Bioplásticos (PHB)
- Ácidos grasos polinsaturados (PUFA’s)
- Pigmentos microbianos
- Biodegradación de grasas