Premio Morosoli, Ciencia y Tecnología (Investigación Aplicada) 2016 a Liliana Borzacconi.
Reconocimiento al trabajo "State of preservation of granular anaerobic sludge after flowing through a pump system", XI DAAL, 2014.
Reconocimiento a la trayectoria a Liliana Borzacconi, XI DAAL 2014.
Premio Maimónides a la ciencia y tecnología "Dr. Víctor y Clara Soriano", otorgado a la Prof. Ing. Quim Liliana Borzacconi, 2013.
Ingenieria de Muestra 2012, Premio del Públioc al mejor stand.
Ingeniería de Muestra 2011, Premio del Público al mejor stand.
Premio mejor poster X DAAL, 2011 a M. Passeggi, M. Benzo, L. Borzacconi, por el trabajo "Codigestión de contenido ruminal".
Premio de la Academia Nacional de Ingeniería 2009 a Iván López por Tesis de Posgrado en Ingeniería.
Premio Mercosur de Ciencia y Tecnología 2008, categoría Integración, otorgado a Claurdia Etchebehere, Elena Castelló, Liliana Borzacconi (Uruguay), Bruna Soares, Eugenio Foresti, Guilehermo Peixoto, Marcelo Zaiat, M. Bernardete Varesche (Brasil) y Nora Saavedra (Perú).
Primer premio del IV Encuentro Regional de Ingeniería Química, AIQU, Montevideo, 2008, otorgado al trabajo "Alternativa anaerobia-aerobia en un tratamiento de efluente a escala real", I. López, M. Passeggi, R. Barcia, L. Borzacconi.
Premio Ministerio de Educación y Cultura 2006, otorgado por la Academia Nacional de Ingeniería, Diseño y puesta en marcha de una planta a escala real para el tratamiento de efluentes de industria láctea.
Primer Premio Arroba 2005, categoría Biotecnología, otorgado por Milenium21, Reactor Anaerobio para tratamiento de efluentes de maltería. 
Mención en IV Congreso nacional de AIDIS Uruguay, noviembre 2003, Punta del Este, Uruguay: López, I., Passeggi, M., Borzacconi, L., Fuentes, I., Lieberman, L. (2003), “Transformación de un tanque imhoff en reactor anaerobio para tratamiento de efluente de maltería sobre la base de una experiencia piloto”.
Premio Abel Wolman de AIDIS, a E. Castelló, D. Ghislieri, A. Ono y L. Borzacconi, 2002.
Mención en el II Encuentro de Ingeniería Química, AIQU, 2000: López, I., Borzacconi, L., “la disposición final de residuos sólidos urbanos: necesidad de un abordaje integral”.
Premio Mención en el II Congreso Regional del Cono Sur de AIDIS, realizado en Montevideo del 1º al 4 de diciembre de 1999: López, I., “El asentamiento en un relleno sanitario y su relación con la biodegradación”, II Congreso nacional y regional de AIDIS Uruguay, Montevideo, Uruguay, diciembre de 1999